Nabend,
die neueren Versionen von Suse, legen die Webseiten standardmässig unterhalb von /var ab, da dort auch das gesamte Logging soviel die Spooler Verzeichnisse liegen, solltest du /var eine extra Partition mit viel Platz gönnen,
wenn es seperate User auf der Kiste gibt, würde ich /home noch eine eigene Partition gönnen,
außerdem noch boot seperat (aber max. 20 MB).
Je nach Struktur der Daten, würde ich zu ext3 oder reiserfs raten, reiserfs hat Vorteile bei sehr vielen kleinen Dateien, dafür hast du für ext3 aufgrund der Abwärtskompatibiltät zu ext2 mehr Tools und außerdem ein undo.
Ansonsten restrikte Firewall drauf, apache so stark abspecken wie möglich, fleissig aktuelle patches einspielen (mit you).. ja, was willste denn noch wissen ?
Gruß
Terran