Hallo,
du hast beim Upgrade die Wahl ob du ein "echtes" Update ausführen möchtest oder eine Neuinstallation, bei einem Update wird übernommen was zu übernehmen ist, ob deine Programme dann jedoch auch unter Vista voll funktionsfähig ist, ist eine andere Frage.
Der Vista Upgrade Advisor (Windows Vista: Upgrade Advisor) kann dabei eine Hilfe sein.
Ich empfehle das vorhandene Windows mit VMware Converter 3.0 zu virtualisieren, eine Neuinstallation von Vista auszuführen, Programme zu installieren, die funktionieren und die Anderen in der VM zu nutzen.
mfg, Shrek