jepps
Da sie eine andere Platte ist, kann sie ruhig auf aktiv stehen. Das gibt ja nur an, welche primäre Partition auf der Festplatte genutzt werden soll. Seit Win2k können aber auch mehrere primäre Partitionen gleichzeitig genutzt werden, weshalb das keinen Einfluss mehr darauf hat, ob man sie sieht oder ob nicht.
Ist das Betriebssystem, das du starten willst, denn auch auf der primären Partition der richtigen Platte? Oder liegt da nur der Bootloader und das zu startende BS auf einer anderen Platte oder Partition, so dass das da irgendwie zu Problemen kommen könnte, wenn plötzlich die andere Platte dazukommt?
Könntest dir mal ein Knoppix runterladen und auf CD brennen und mal davon versuchen zu booten - dann könntest du dir die Platte mal anschauen, ob damit alles in Ordnung ist und falls du eine FAT32-PArtition haben solltest (bei NTFS würde ich noch immer die Finger vom schreiben lassen), die benötigten Daten darunter rüberziehen...