Dieser Ansatz wird dich nicht weit bringen. Das ist so, als würdest du ein Auto komplett selbst bauen wollen, und mit dem Lenkrad anfangen, weil du bei einem vorgefertigten Auto damit am meisten zu tun hast. Das Lenkrad bringt aber nichts ohne einen relativ großen Unterbau, von dem der normale Autofahrer nicht viel mitbekommt.
Mit MFC ist es ähnlich. Der Assistent generiert schon recht minimalen Code. Erstell einfach eine dialogbasierte MFC-Anwendung ohne About-Dialog und ohne ActiveX-Steuerlemente.
Dann hast du zwei Klassen, eine von CWinApp abgeleitet, und eine von CDialog. Von der App-Klasse gibt es ein globales Objekt. Zuerst wird dessen Konstruktor aufgerufen (den lässt der Assistent leer), dann wird InitInstance aufgerufen, das wiederum eine Instanz der Dialogklasse erstellt und anzeigt. So viel ist das nicht, dass du dir die Kugel geben müsstest
Und wenn du etwas an dem generierten Code nicht verstehst, kannst du gern hier fragen.