Hallo N4wuko,
SSH ist in der Windows Welt eher unüblich, gleichwohl aber möglich. Du kannst den Server sowohl Shell basiert (Powershell) aus der Ferne administrieren oder per RDP, vorzugsweise über eine VPN-Verbindung.
Absichern...nun ja. Seit 2008 werden nur noch wenige Basis Features mitinstalliert, so dass das Angriffsprofil im Vergleich zu Vorgänger Versionen schon um einiges kleiner geworden ist. Ansonsten realisiert man Server die aus dem Web erreichbar sein sollen über eine DMZ, was aber bei Linux ja genau dasselbe ist. Extra abzusichern ist da eher weniger vonnöten.